Igralci igrajo "EteRNA" Samo premagal strokovno znanost na to ključno odkritje

Državljanska znanost je šla na naslednjo stopnjo: video igralci so odkrili biološko stanje, zdaj pa jo je objavila strokovna revija.

Ta teden je objavljen v Revija za molekularno biologijo, serijo intuitivno razvitih pravil za težko doseganje določene oblike z oblikovanjem RNA. Ugotovili so, na primer, da je bolj simetrična oblika, težje je oblikovati pramen RNK, da se ujema z njim.

Skupina video igralcev je odkritje dosegla z igranjem, EteRNA Igra, ki izziva igralce, da vzamejo pramene RNA in jih zložijo v želeno obliko s spreminjanjem svoje kemične sestave. Znanstveni problem zlaganja RNA v določeno obliko je kompleksen, vendar igra ni - za začetek igranja ni potrebno razumevanje biokemije.

Igralci so se lotili raziskovalnega vprašanja na lastno pobudo, kot način, s katerim novejšim igralcem omogočajo presojo relativne težavnosti različnih ugank. Ugotovitve bodo pomagale pri usmerjanju prihodnjih biomedicinskih raziskav, saj nov sklop pravil daje znanstvenikom boljši občutek o tem, ali je poskus RNA preoblikovati v določeno obliko brezplodna vaja.

"Te raziskave kažejo, da je mogoče standardno paradigmo znanstvenega množičnega iskanja preobrniti," je povedal Rhiju Das, profesor biokemije na Stanfordu. Inverse v e-poštnem sporočilu. EteRNA Leta 2011 sta ga predstavila Das in Adrien Treuille, docentka za računalništvo na Univerzi Carnegie Mellon. “ EteRNA igralci lahko oblikujejo lastna raziskovalna vprašanja in lahko napišejo svoje članke. V tej raziskavi so strokovnjaki v mojem laboratoriju podali nekaj navodil in neodvisnega testiranja."

Sintetizirana RNA ima neverjeten potencial za novo generacijo zdravil in medicinskih terapij. Če ga lahko zložimo v pravo obliko, lahko RNA zgradimo tako, da usmerimo na specifične viruse, rak in celo na genetske motnje. CRISPR, proces urejanja genov, ki lahko dramatično spremeni prihodnost človeškega obstoja, uporablja RNA za usmerjanje encima za rezanje DNA, Cas9, v nezaželen del DNK.

EteRNA se je začel kot forum za strokovnjake, ki so igralcem predstavili uganke, vendar se je od takrat še povečal. Igra in njeni 100.000 registriranih igralcev zdaj obstajajo v simbiotičnem in razvijajočem se odnosu s strokovnimi znanstveniki in računalniškimi modeli, ki so zasnovani za oblikovanje in testiranje RNA strukture.

»Računalniško modeliranje in EteRNA niso izključne, ”pravi Das. “ EteRNA združuje veliko ljudi, od katerih nekateri pišejo svoje računalniške modele."

V tekočem članku so igralci sodelovali pri pisanju scenarijev, da bi preizkusili svoje zamisli o tem, kaj naredi strukture RNA težko oblikovati. Das pravi, da so mu nekateri igralci povedali, da so še posebej navdušeni, da svoje ideje avtomatizirajo v računalniške modele, ker želijo nadaljevati in reševati težje probleme.

Težave, ki so jih zgradili EteRNA igralci se dejansko sintetizirajo v Dasovem laboratoriju - doslej je bilo ustvarjenih 86.459 zaporedij, ki jih je ustvaril igralec.

Glavni avtorji prispevka so bili EteRNA igralci igre Jeff Anderson-Lee, Eli Fisker, Vineet Kosaraju in Michelle Wu. Wu je tudi doktor znanosti. študent biomedicinske informatike na Stanfordu.

V prihodnosti bi lahko državni strokovnjaki začeli objavljati znanstvena odkritja popolnoma neodvisno.

»Ta„ zrcalna “vzorca za državljansko znanost bi lahko bila koristna za druge projekte in področja znanosti, kot je astronomija (Galaxy Zoo) ali množično identifikacijo vrst (Črtna koda življenja), «Pravi Das. »Še posebej, če so EteRNA vidijo ozka grla v fazi pisanja na papirju."