Графы в биоинформатике | Николай Вяххи | Лекториум
Aprila so oblasti na območju Sacramenta ujele posiljevalca in morilca, znanega kot Golden State Killer - z uporabo javno dostopnih genetskih podatkov. Kmalu po aretaciji Josepha Jamesa DeAngela je bilo razkrito, da je potrošniška genomska podatkovna zbirka GEDmatch.com pomagala pri koncu 40-letne preiskave. Organi pregona so DeAngelo povezali s svojim nizom kaznivih dejanj s pomočjo podatkov o DNK svojih sorodnikov, ki so bili na voljo na spletu. V študiji, objavljeni v četrtek v reviji Znanost Raziskovalci poudarjajo, da bo testiranje potrošnikov verjetno postalo bolj prevladujoče in močnejše - vendar se to lahko zgodi na račun naše zasebnosti, saj nas lahko javno dostopne genetske baze podatkov identificirajo, tudi če nismo prispevali k njim.
Od aprila 2018 je več kot 15 milijonov ljudi uporabilo avtosomne genetske teste z neposrednim dostopom do potrošnikov. Te vključujejo storitve, kot sta 23andMe in Helix. V novi študiji raziskovalci pojasnjujejo, da ta poplava sodelovanja pomeni, da postaja zelo preprosto identificirati ljudi po njihovi DNK prek javnih genetskih baz podatkov, čeprav sami niso bili podvrženi genetskemu testiranju. Avtorji študije poročajo, da je mogoče identificirati vsaj 60 odstotkov posameznikov v Združenih državah z evropskim poreklom.
Ta študija se je posebej osredotočila na Američane evropskega porekla, ker je ta populacija preveč zastopana v podatkovnih bazah DNA. Skupina je analizirala podatkovni niz, ki je obsegal več kot 1,2 milijona anonimnih posameznikov, ki so opravili komercialno sekvenciranje prek podjetja My Heritage (soavtor študije dr. Yaniv Elrich je glavni znanstveni direktor podjetja). Ugotovili so, da lahko znanstveniki za približno 60 odstotkov ljudi v podatkovnem nizu najdejo družinskega člana z ustreznimi segmenti DNA. Ko se te informacije združijo z javno dostopnimi genealoškimi zapisi in se najde eden ali več sorodnikov, ni težko ugotoviti, kdo pripada DNK.
»Ta tehnika,« pišejo znanstveniki, »bi lahko v bližnji prihodnosti vključevala skoraj vsakega posameznika iz Evrope, ki je evropsko poreklo.«
To je navidezno dobra novica za forenzične znanstvenike in policiste - in poudarja tveganje zasebnosti za ljudi na splošno. Znanstveniki poudarjajo, da je zato, ker je tako enostavno slediti ljudem prek podatkov o DNK, treba oblikovati nove politike za zaščito njihove zasebnosti in zaustavitev zlorabe informacij:
Če vzamemo skupaj, trdimo, da naši rezultati zahtevajo prevrednotenje statusa quo glede prepoznavnosti podatkov o DNK, zlasti ameriških posameznikov. Čeprav lahko oblikovalci politik in splošna javnost zagovarjajo takšne okrepljene forenzične zmogljivosti za reševanje kaznivih dejanj, se zanašajo na podatkovne baze in storitve, ki so dostopne vsem. Tako bi lahko enako tehniko uporabili tudi za škodljive namene, kot je ponovna identifikacija raziskovalnih subjektov iz njihovih genetskih podatkov.
Znanstveniki prav tako trdijo, da če zakonski organi združijo DNK s prizoriščem kaznivega dejanja z javno dostopnimi informacijami o DNK, lahko verjetno spustijo svojo bazo osumljencev na približno 17 ljudi. Ker več ljudi uporablja teste genetike potrošnikov - nekaj, kar ti avtorji pravijo, je neizogibno - bo ta proces postal lažji. Z matematičnim modeliranjem so ugotovili, da se, ko genetske baze podatkov pokrivajo vsaj 2 odstotka ciljne populacije, skoraj vsaka oseba v tej skupini lahko primerja vsaj na tretji ravni bratranca.
Ta pot ponuja močno alternativo forenzičnim organom za iskanje podatkovnih baz, na katere so se do zdaj zanašali - vendar to tudi pomeni, da bi lahko nedolžni četrti bratranec, ki ne ve, da so njihovi podatki tam zunaj, potrkal na vrata.
Povzetek študije:
Podatkovne baze genomike potrošnikov so dosegle obseg milijonov posameznikov. Nedavno so organi kazenskega pregona izkoristili nekatere od teh zbirk podatkov, da bi prepoznali osumljence prek oddaljenih družinskih sorodnikov. Z uporabo genomskih podatkov 1,28 milijona posameznikov, testiranih s potrošniško genomiko, smo raziskali moč te tehnike. Projektiramo, da bo približno 60% iskanj posameznikov z evropskim poreklom povzročilo tretji bratranec ali bližje ujemanje, ki lahko omogoči njihovo identifikacijo z uporabo demografskih identifikatorjev. Poleg tega bi tehnika lahko v bližnji prihodnosti vključevala skoraj vsakega posameznika iz Evrope, ki je evropsko poreklo. Dokazujemo, da lahko tehnika tudi identificira udeležence raziskave v javnem projektu sekvenciranja. Na podlagi teh rezultatov predlagamo potencialno strategijo za ublažitev in politične posledice za raziskave človeških subjektov.
Vas zanima DNK? Nato opazujte, da ti DNA nanoroboti uničijo tumorje:
FCC vodja Tom Wheeler želi internetno zasebnost, urejeno kot zasebnost telefona
Tom Wheeler, predsednik Zvezne komisije za komunikacije, je v zadnjem času na poti, ki moti kabelske omarice in si prizadeva za širokopasovni dostop do družin z nizkimi dohodki v višini 9,25 USD, zdaj pa si prizadeva za pomanjkanje zaščite zasebnosti pred ponudniki internetnih storitev. V izdaji za The Huffington Post so objavljene tod ...
Študija kaže, da dirka sproži nasilje v policiji, ne pa tudi streljanje
Nova študija, ki jo je danes pripravil nacionalni urad za ekonomska raziskovanja, kaže, da je policija bolj nasilna do črncev, vendar jih ne streljajo pogosteje kot druge dirke. Rezultati prihajajo, ko Baton Rouge in Minneapolis žalujejo za Alton Sterling in Philando Castile, dva črna moža, ki sta ju ubila aktivna dežela.
Študija velikih akupunkturnih študij kaže pomemben vpliv na bolečino
Znanstvene študije o akupunkturi so redke. Redko obsežno preskušanje kaže, da ima pomembne učinke lajšanja bolečin na ljudi z bolečino, ki jo povzroča rak.