Organizem z najmanjšim genomom ima še vedno 30 odstotkov skrivnostnih genov

Skupina genetikov, ki jo vodi slavni, pametni kreten J. Craig Venter, je leta 2010 ustvarila valove, ko je ustvarila popolnoma sintetične bakterije. Skupina se spet znova ukvarja s klicami, ki jih je ustvaril človek, toda tokrat, genetsko gledano, je trimer - umetno Mycoplasma mycoides genom je majhnih 473 genov. Še bolj čudno pa je, da raziskovalci ne vedo, kaj 149 teh genov dela.

Enocelični organizem »ima genom manjši od katerega koli avtonomno replicirajoče celice v naravi,« piše pretežno kalifornijska raziskovalna skupina. Znanost članek, objavljen danes. (Parazitska bakterija, ki se opira na gostiteljske insekte za razmnoževanje, ima le 182 genov.) Raziskovalci so bili prepričani, da to ni najmanjši genom, ampak eden mogoče minimalni genom za bakterije M. mycoides.

Zaradi pogojev, ki so jih znanstveniki zahtevali od kalčkov - ki so živeli s plesniškim življenjem v petrijevki, bogati z glukozo - ni bilo nobenega tujega genskega materiala. Stvar je v tem, da je funkcija 32 odstotkov tega materiala skrivnost.

Raziskovalci pišejo:

Neznani geni so bili tisti, ki jih ni bilo mogoče zanesljivo kategorizirati glede na domnevno dejavnost.

Tako bioloških funkcij ni bilo mogoče dodeliti za ~ 31% genov, ki so bili umeščeni v generične in neznane razrede. Kljub temu so bili potencialni homologi za številne od teh najdeni v različnih organizmih. Mnogi od teh genov verjetno kodirajo univerzalne proteine, katerih funkcije še niso opisane.

Bakterijski genom, ki vsebuje le gene, potrebne za življenje, ki ga je zgradila ekipa pod vodstvom @JCVenter http://t.co/bSM6E54Gvn pic.twitter.com/QrzDBz6bHm

- AAAS (@aaas) 24. marec 2016

Da še vedno obstajajo genetske neznanosti, ko poskušamo destilirati življenje na svoje najosnovnejše, res ne bi smelo priti kot bomba. Ljudje imajo na tisoče genov, vendar vsi nimajo ekspresne vhodno-izhodne funkcije. Kar je bilo nekoč znano kot »junk DNA« pred desetletji - DNK, ki ne izrecno kodira znanih beljakovin - je bilo oddano v novo svetlobo, morda ureja druge funkcije na subtilne načine ali zagotavlja pomembne zaščitne ukrepe.

Organizem za peko od prask ni samo znanstveni podvig, čeprav se nekatere aplikacije sintetične biologije še vedno zdijo zelo daleč. Kot Washington Post ugotavlja, da Venter predvideva, da bi, če bi našli Marijin genom za tujce, potrebovali samo podatke, ne pa biološkega materiala - podobno kot faksiranje celice namesto pošiljanja po pošti.